برخی از میکروب‌های روده ممکن است مدت‌ها قبل از شروع اولین علائم، ابتلا به بیماری آلزایمر را هشدار دهند. در آلزایمر، دو پروتئین به نام‌های آمیلویید بتا و تاو به‌طور غیرطبیعی در مغز تجمع می‌یابند و منجر به از دست دادن مشخصه حافظه و زوال شناختی مرتبط با این بیماری می‌شوند و علائم با گذشت زمان بدتر خواهد شد. 
محققان تفاوت‌های مشخصی در پروفایل میکروبیوم روده افراد مسن با و بدون علائم آلزایمر پیش‌بالینی پیدا کردند. در افرادی که علائم آلزایمر پیش‌بالینی داشتند، به نظر می‌رسد که تفاوت‌ها در میکروبیوم روده با تجمع پروتئین‌های آمیلویید بتا و تاو در مغز مرتبط است. در حال حاضر، پزشکان برای ارزیابی اینکه آیا ممکن است فردی به آلزایمر پیش‌بالینی مبتلا باشد، بر نتایج آزمایش‌های تشخیصی مختلف تکیه می‌کنند. محققان دریافتند که گنجاندن داده‌های میکروبیوم روده توانایی الگوریتم را برای تشخیص دقیق آلزایمر پیش‌بالینی بهبود می‌بخشد.