حضرت آیت‌الله خامنه‌ای، رهبر معظم انقلاب اسلامی، از حضور پرشکوه و حماسی مردم در دوازدهمین دوره انتخابات ریاست جمهوری و پنجمین دوره انتخابات شوراهای اسلامی شهر و روستا تشکر و قدردانی کردند. به گزارش پایگاه اطلاع‌رسانی دفتر مقام معظم رهبری، ایشان در بخشی از پیام خود خطاب به ملت ایران نوشته‌اند: «جشن حماسی انتخابات دیروز،‌ بار دیگر گوهر درخشانِ عزم و اراده ملی را در برابر چشم جهانیان به جلوه آورد. مشارکت گسترده و پرشور شما، و هجوم مشتاقانه به مراکز رأی‌گیری، و تشکیل صف‌های طولانی برای رسیدن به صندوق‌های رأی در همه جای کشور، و از همه قشرهای اجتماعی، نشانه‌ای آشکار از استحکام پایه‌های مردم‌سالاری اسلامی و دلبستگی همگانی به این موهبت بزرگ پروردگار بود و ایران و ایرانی را در آزمونِ میدان عمل، سرافراز و روسفید کرد.» آیت‌الله خامنه‌ای در ادامه با اشاره به ثبت حدنصاب تازه‌ای از میزان مشارکت در انتخابات ریاست جمهوری آورده‌اند: «پیروز انتخابات دیروز شما مردم ایرانید و نظام جمهوری اسلامی است، که به رغم توطئه و تلاش دشمنان توانسته است اعتماد این ملت بزرگ را به طور فزاینده جلب کند و در هر دوره درخشش تازه‌ای نشان دهد. آزمون برجسته دیروز تنها مشارکت گسترده نبود، آرامش و متانت و نجابت شرکت‌کنندگان، که امنیت انتخابات را تضمین کرد، نیز بخش مهمی از این آزمون خیره‌کننده بود.» رهبر انقلاب در بخش دیگری از پیام خود با ذکر این نکته که «اینجانب با خشوع در برابر خدای بزرگ، جبهه سپاس بر خاک می‌سایم، و لطف و رحمت و پاداش شایسته برای ملت ایران مسئلت می‌نمایم» نکاتی چند را بدین شرح متذکر شده‌اند:

۱ ـ به مردم عزیز عرض می‌کنم خدای را بر موفقیت در برگزاری انتخابات شکرگزارید و پس از التهابِ روزها و هفته‌های پیش از انتخابات، اکنون به اتحاد و اتفاق عمومی بیندیشید که بی‌شک عامل مهم استحکام و اقتدار ملی است. همه در زیر سایه نظام جمهوری اسلامی و فرزندان این میهنِ سرافرازید، بکوشید تا سهم خود از وظیفه پیشبرد کشور به سمت هدف‌های بزرگ را بشناسید و دنبال کنید. برآمدن همه آرزوهای ملی در گرو چنین اندیشیدن و چنین عمل کردنی است.

۲ ـ به رئیس‌جمهور محترم و همه کسانی که در دولت آینده شرکت خواهند داشت سفارش و تاکید می‌کنم که کار و تلاش پرانگیزه و اندیشیده و جوانانه را برای برطرف کردن مشکلات کشور در پیش گیرند و لحظه‌ای از این خط مستقیم غفلت نکنند. رعایت قشرهای ضعیف، توجه به روستاها و مناطق فقیر، در نظر گرفتن اولویت‌ها، برخورد با فساد و با آسیب‌های اجتماعی، باید در صدر برنامه‌ها قرار بگیرد.

۳ ـ عزت ملی و رعایت حکمت در ارتباطات جهانی و اهتمام به اقتدار بین‌المللی نیز ازجمله اولویت‌های مدیریت انقلابی و اسلامی است.

۴ ـ لازم می‌دانم از یکایک آحاد شرکت‌کننده در انتخابات و نیز کسانی که در ترغیب آنان به این وظیفه نقش آفریدند تشکر کنم، به‌ویژه مراجع معظم و علمای اعلام و نخبگان دانشگاهی و سیاسی و فرهنگی و هنری.

۵ ـ لازم می‌دانم از حضرات نامزدهای ریاست جمهوری نیز که در این روشنگری و شورآفرینی برای انتخابات تاثیر جدی بر جای نهادند تشکر کنم.

۶ ـ لازم می‌دانم از همه دست‌اندرکاران اجرا و نظارت انتخابات ریاست جمهوری و نیز انتخابات شوراهای شهر و روستا که متحمل زحمات طاقت‌فرسا شدند تشکر کنم.

۷ ـ لازم می‌دانم از حافظان امنیت انتخابات و نیز از رسانه ملی، که انتخابات پرشور مرهون تلاش شبانه‌روزی و هنرمندانه آنان است، سپاسگزاری کنم.

۸ ـ در پایان، خود و همگان را به تقوا و تلاش در راه وظیفه الهی و اجتماعی و پایبندی به مسیر انقلاب، که میراث ارزشمند امام خمینی بزرگ و شهدای گرانمایه است، دعوت می‌کنم و شادی روح و علو درجات آنان را از خداوند متعال مسئلت می‌نمایم.